远在罗马尼亚乡间的一所修道院发生修女自杀事件。为此，梵蒂冈委派伯克神父（德米安·比齐尔DemiánBichir饰）和见习修女艾琳（泰莎·法米加TaissaFarmiga饰）前去调查。抵达目的地后，他们首先找到了定期给该修道院运送物资的法国青年弗兰切（乔纳斯·布洛凯JonasBloquet饰），而他正是第一个发现修女尸体的目击人。三人进入修道院，里面的气氛阴森鬼魅，修女们则飘忽不定，有如幽灵。看不见面容的修道院长称修女们正在静默祈祷，第二天才能回答他们的问题。无奈之下，伯克神父一行只好暂时在修道院落脚。可是随着夜幕降临，真正的恐怖开始浮现，恶魔对虔诚的信仰展开了毫无差别的狙杀……

1952 年，罗马尼亚，两名住在圣卡塔修道院的修女在进入隧道取回一件古老的基督教圣物时遭到了看不见的邪恶力量的袭击。幸存的修女维多利亚修女逃离了以修女身份出现的恶魔袭击者，并上吊自杀。她的尸体被为修女们运送物资的村民弗兰奇发现。

梵蒂冈得知此事后，将伯克神父召至罗马，并请他与见习修女艾琳修女一起前往罗马尼亚调查情况。当艾琳修女在一所学校教孩子们宗教与科学之间的关系时，她的院长打断了她，并告诉她伯克已经到达，以便请求艾琳陪同他前往罗马尼亚。

两人前往罗马尼亚并会见了弗兰奇，弗兰奇带领他们去了修道院。他们发现了维多利亚的尸体，并从她的尸体上取出了一把钥匙。在里面，他们遇到了女修道院院长，女修道院院长告诉他们，修女们在晚上要保持一段时间的静默，如果他们想明天返回，他们会在附属修道院提供住宿。弗兰西返回村庄时遭到恶魔袭击，但他逃脱了。伯克告诉艾琳，他过去驱魔的一个男孩丹尼尔在仪式中受了致命伤，伯克承担了男孩死亡的重担。艾琳透露，作为一个女孩，她曾有过异象，每个异象的结论都是“玛丽指出了道路”，引起了教会对她的兴趣。当晚，伯克被艾琳救下。被恶魔实体活埋在墓地里。

第二天，艾琳和伯克回到修道院，但由于修道院与世隔绝，只有艾琳可以进入。她遇到了其他一些修女，并了解到她们不断地轮班祈祷，以阻止该实体的入侵。奥安娜修女透露，这座修道院建于黑暗时代，是一座供圣卡塔公爵使用的城堡，圣卡塔公爵是一位痴迷于神秘学的强大贵族。公爵通过地下墓穴的裂缝召唤了恶魔，但被基督教骑士杀死，他们用装满基督之血的小瓶密封了裂缝。然而，第二次世界大战期间的爆炸事件重新打开了裂痕，释放了该实体。伯克辨认出这个恶魔就是瓦拉克，并发现女修道院院长一直都死了。

弗朗西回到修道院帮助艾琳和伯克。艾琳遭到瓦拉克的袭击，她与修女们一起绝望地祈祷，以抵御恶魔。当大家重聚时，艾琳发现她所见过和交谈过的修女都不是真实的，她一直在独自祈祷，后来意识到维多利亚修女是修道院里最后一个修女，为了阻止瓦拉克占有她的身体并释放邪恶而牺牲了自己。

理论上说，只有用圣物盒中基督的血封住裂缝，才能阻止瓦拉克，三人取回了装有维多利亚钥匙的小瓶。艾琳告诉伯克，上帝召唤她庄严宣誓成为一名修女，并要求伯克将她提升为一名自称修女的身份，他在修道院的小教堂里这样做了。

三人打开隧道门后，艾琳被引诱进入五角星并被瓦拉克附身。弗朗西将基督的血涂在脸上，驱逐了恶魔。当瓦拉克开始在被水淹没的房间里淹死艾琳时，伯克被丹尼尔的鬼魂打伤。艾琳将基督的血驱逐到恶魔的脸上，在裂缝被密封的同时将其驱逐。弗朗奇救活艾琳后，透露自己的名字叫莫里斯。其他人不知道的是，莫里斯已经被瓦拉克附身了，他脖子后面有一个倒置的十字架就证明了这一点。

二十年后，在马萨诸塞州韦克菲尔德的一次大学研讨会上，卡罗琳·佩隆观看艾德·沃伦和洛林·沃伦展示他们试图驱除被附身的莫里斯的镜头。在镜头中，莫里斯抓住洛林，让她看到艾德垂死的幻象，导致她惊恐地尖叫，并将自己锁在卧室里八天，这引发了沃伦夫妇对佩伦农舍闹鬼事件的调查。